Džemat Klisa je nastao izdvajanjem iz džemata Kozluk. Prvi mekteb u Klisi je sagrađen 1910. godine. Zemljište gdje se danas nalazi džamija je uvakufio Džemil Omerović sa hanumom Eminom. Gradnja džamije je poćela 1979., a svečano ozvorena 1982. godine. Gosti vaizi na otvaranju džamije su bili: Husein ef. Smajić, vjerskoprosvetni refernt Odbora Islamske zajednice Zvornik, hfz. Husein ef. Mijić, muftija tuzlanski, dr. Ahmed ef. Smajlović, predsjednik Starješinstva Islamske zajednice za Bosnu i Hercegovinu, Hrvatsku i Sloveniju. Čast da otvori džamiju je imamo vakif zemljišta Džemil Omerović. Džamija je uništena 1992. godine. Prva džuma nakon rata je klanjana u martu 1999. godine u razrušenoj džamiji. Iste godine je počela njena obnova. Do 2004. godine je završena obnova džamije i mektebske učionice koja je uz samu džamiju, mesdžida sa munarom u Šeticima i mekteb u Kaludranima.
U Klisi postoji šehidska česma, koja je prema predaji bila motiv da se stanovnici ovog naselja u njemu nekada davno nastane i ostanu da žive. Za stradale u agresiji na Bosnu i Hercegovinu (1992-1995.) izgrađeno je šehidsko spomen obilježje. Za šehidsko mezarje zemljište je uvakufio Alić Smajo. Imami u džematu su bili: Mehmed ef. Jašarević do 1957., Mehdin ef. Jašarević od 1957. do 1991. godine. Od 1991. do 1992. imam je bio Sakib ef. Bajrić koji je odveden zajedno sa svojim džematlijama. Tijelo mu je identifikovano i ukopan je u šehidskom mezarju u Memićima. Iza njega je ostalo dvoje djece i roditelji.
Imamsku dužnost od 1999. do danas obavlja Senajid ef. Alić. Rrođen 24. aprila 1976. godine u Loznici. Osnovnu školu završio 1990. u Petkovcima. Gazi Husref-begovu medresu upisao u školskoj 1990/91., a završio nakon rata.